一世の屋敷に行ってから数日。遊びに出かけるルパンを、しのぶが厳しく監視するようになった。

おちおち出かけられないルパンは一つ妙案を思いつく。

「学校にアジトを作っちまえばいいんだ！」――次元を誘い、敷地内に二人の秘密基地を作り始めるルパン。

だが、天才的なルパンの思いつきはハチャメチャすぎてとどまるところを知らず、アジト作りは難航を極め……？